9/1現在、日本国内で就航しているLCCは4社です。
採算が取れない路線などは順次廃線になっていくことが多いLCCでは、半年前までは飛んでいたけど、今は飛んでいないなんてこともあるので下調べをしっかりしてないと飛行機で行くことさえできなくなってしまうことがあるので注意してください。
ピーチ
・大阪/関西 ⇔ 札幌/千歳
・大阪/関西 ⇔ 仙台
・大阪/関西 ⇔ 東京/成田
・大阪/関西 ⇔ 松山
・大阪/関西 ⇔ 福岡
・大阪/関西 ⇔ 長崎
・大阪/関西 ⇔ 鹿児島
・大阪/関西 ⇔ 沖縄/那覇
・大阪/関西 ⇔ 石垣
・沖縄/那覇 ⇔ 福岡
ジェットスター
・東京/成田 ⇔ 札幌/千歳
・東京/成田 ⇔ 大阪/関西
・東京/成田 ⇔ 高松
・東京/成田 ⇔ 松山
・東京/成田 ⇔ 福岡
・東京/成田 ⇔ 大分
・東京/成田 ⇔ 熊本
・東京/成田 ⇔ 鹿児島
・東京/成田 ⇔ 沖縄/那覇
・名古屋/中部 ⇔ 札幌/千歳
・名古屋/中部 ⇔ 福岡
・名古屋/中部 ⇔ 熊本
・名古屋/中部 ⇔ 鹿児島
・大阪/関西 ⇔ 札幌/千歳
・大阪/関西 ⇔ 福岡
・大阪/関西 ⇔ 大分
・大阪/関西 ⇔ 熊本
・大阪/関西 ⇔ 沖縄/那覇
バニラエア
・東京/成田 ⇔ 札幌/千歳
・東京/成田 ⇔ 沖縄/那覇
・東京/成田 ⇔ 奄美大島
春秋航空日本
・東京/成田 ⇔ 広島
・東京/成田 ⇔ 高松
・東京/成田 ⇔ 佐賀
中部だけLCCの数が少ない
おそらく関東から中部（名古屋）へは飛行機を使うより新幹線を使った方が早いためかあまりLCCは飛んでいません。
唯一飛んでいるのがジェットスターですが、九州・沖縄のみの就航です。
スカイマークに関してはLCCという位置づけではなさそうなので今回は省いています。